Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp9cQ66X01 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9cQ66X01 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms