Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20917Q62457 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20917Q62457 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20917Q62457 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms