Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd180Q62192 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd180Q62192 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms