Protein–RNA interactions for Protein: Q61127

Nab2, NGFI-A-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab2Q61127 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nab2Q61127 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nab2Q61127 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nab2Q61127 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nab2Q61127 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nab2Q61127 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms