Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp4Q61107 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp4Q61107 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms