Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Csnk2a1Q60737 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csnk2a1Q60737 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms