Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CluhQ5SW19 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms