Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r195Q5SVD6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r195Q5SVD6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms