Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE3

Ccdc92b, Coiled-coil domain-containing 92B, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92bQ5SUE3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc92bQ5SUE3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc92bQ5SUE3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms