Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TefmQ5SSK3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TefmQ5SSK3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TefmQ5SSK3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TefmQ5SSK3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms