Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo39Q5NBU5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo39Q5NBU5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo39Q5NBU5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo39Q5NBU5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo39Q5NBU5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo39Q5NBU5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo39Q5NBU5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo39Q5NBU5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo39Q5NBU5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo39Q5NBU5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo39Q5NBU5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo39Q5NBU5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo39Q5NBU5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo39Q5NBU5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fbxo39Q5NBU5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms