Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q504N7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q504N7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q504N7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q504N7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q504N7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q504N7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q504N7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q504N7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q504N7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q504N7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q504N7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q504N7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q504N7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q504N7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q504N7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q504N7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q504N7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q504N7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q504N7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q504N7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q504N7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q504N7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q504N7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q504N7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q504N7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q504N7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q504N7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q504N7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q504N7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q504N7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q504N7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q504N7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q504N7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q504N7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q504N7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q504N7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q504N7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q504N7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q504N7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q504N7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q504N7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q504N7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q504N7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q504N7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q504N7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q504N7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q504N7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q504N7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q504N7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q504N7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q504N7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q504N7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q504N7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q504N7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q504N7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q504N7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q504N7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q504N7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q504N7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q504N7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q504N7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q504N7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q504N7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q504N7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q504N7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q504N7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q504N7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q504N7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q504N7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q504N7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q504N7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q504N7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q504N7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q504N7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q504N7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q504N7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q504N7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q504N7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q504N7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q504N7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q504N7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q504N7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q504N7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q504N7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q504N7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q504N7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q504N7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q504N7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q504N7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q504N7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q504N7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q504N7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q504N7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q504N7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q504N7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q504N7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q504N7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q504N7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q504N7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms