Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BC051142Q3V0M8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC051142Q3V0M8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms