Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
4930567H17RikQ3V0K5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
4930567H17RikQ3V0K5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms