Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn13Q3UW68 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn13Q3UW68 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms