Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Prdm10Q3UTQ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prdm10Q3UTQ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms