Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtl4Q3URY0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rtl4Q3URY0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms