Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mccc2Q3ULD5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms