Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Lmod2Q3UHZ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lmod2Q3UHZ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Lmod2Q3UHZ5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms