Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF7

Hivep2, Transcription factor HIVEP2, mousemouse

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep2Q3UHF7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hivep2Q3UHF7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hivep2Q3UHF7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hivep2Q3UHF7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hivep2Q3UHF7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms