Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk3Q3U3Q1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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