Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srebf2Q3U1N2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srebf2Q3U1N2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srebf2Q3U1N2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srebf2Q3U1N2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srebf2Q3U1N2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srebf2Q3U1N2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srebf2Q3U1N2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srebf2Q3U1N2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Srebf2Q3U1N2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srebf2Q3U1N2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srebf2Q3U1N2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Srebf2Q3U1N2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms