Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2f1Q3THK3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms