Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rundc1Q0VDN7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rundc1Q0VDN7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms