Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pate4Q09098 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms