Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Runx2Q08775 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Runx2Q08775 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms