Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ascl1Q02067 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms