Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bop1P97452 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bop1P97452 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bop1P97452 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bop1P97452 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Bop1P97452 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms