Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Sema3eP70275 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema3eP70275 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema3eP70275 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema3eP70275 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema3eP70275 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema3eP70275 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3eP70275 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3eP70275 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3eP70275 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3eP70275 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3eP70275 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3eP70275 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3eP70275 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms