Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cntn5P68500 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn5P68500 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms