Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SnrpfP62307 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms