Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps11P62281 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps11P62281 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps11P62281 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps11P62281 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps11P62281 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps11P62281 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps11P62281 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps11P62281 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps11P62281 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps11P62281 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps11P62281 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms