Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps29P62274 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps29P62274 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps29P62274 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps29P62274 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps29P62274 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps29P62274 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps29P62274 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps29P62274 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps29P62274 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rps29P62274 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rps29P62274 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rps29P62274 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rps29P62274 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rps29P62274 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rps29P62274 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rps29P62274 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rps29P62274 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps29P62274 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps29P62274 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps29P62274 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps29P62274 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rps29P62274 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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