Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samsn1P57725 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Samsn1P57725 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms