Protein–RNA interactions for Protein: P52480

Pkm, Pyruvate kinase PKM, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkmP52480 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PkmP52480 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PkmP52480 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PkmP52480 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PkmP52480 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PkmP52480 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PkmP52480 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PkmP52480 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PkmP52480 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PkmP52480 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PkmP52480 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PkmP52480 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PkmP52480 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PkmP52480 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PkmP52480 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PkmP52480 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PkmP52480 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PkmP52480 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PkmP52480 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PkmP52480 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PkmP52480 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PkmP52480 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PkmP52480 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PkmP52480 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PkmP52480 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PkmP52480 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PkmP52480 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PkmP52480 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PkmP52480 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PkmP52480 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PkmP52480 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PkmP52480 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PkmP52480 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PkmP52480 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PkmP52480 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PkmP52480 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PkmP52480 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PkmP52480 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PkmP52480 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PkmP52480 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PkmP52480 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PkmP52480 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PkmP52480 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PkmP52480 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PkmP52480 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PkmP52480 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PkmP52480 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PkmP52480 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PkmP52480 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PkmP52480 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PkmP52480 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PkmP52480 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PkmP52480 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PkmP52480 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PkmP52480 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PkmP52480 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PkmP52480 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PkmP52480 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PkmP52480 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PkmP52480 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PkmP52480 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PkmP52480 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PkmP52480 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PkmP52480 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkmP52480 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkmP52480 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkmP52480 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkmP52480 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkmP52480 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkmP52480 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkmP52480 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkmP52480 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkmP52480 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PkmP52480 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PkmP52480 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PkmP52480 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkmP52480 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkmP52480 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkmP52480 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkmP52480 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkmP52480 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkmP52480 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkmP52480 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkmP52480 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkmP52480 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkmP52480 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkmP52480 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkmP52480 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkmP52480 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkmP52480 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkmP52480 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkmP52480 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkmP52480 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkmP52480 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkmP52480 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkmP52480 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PkmP52480 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PkmP52480 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PkmP52480 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PkmP52480 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms