Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pa2g4P50580 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pa2g4P50580 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pa2g4P50580 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms