Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx1-2P42580 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nkx1-2P42580 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms