Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Acvr1P37172 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acvr1P37172 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acvr1P37172 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms