Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PpardP35396 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PpardP35396 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PpardP35396 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PpardP35396 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PpardP35396 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PpardP35396 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PpardP35396 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PpardP35396 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PpardP35396 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PpardP35396 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PpardP35396 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PpardP35396 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PpardP35396 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PpardP35396 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PpardP35396 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PpardP35396 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PpardP35396 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PpardP35396 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PpardP35396 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PpardP35396 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PpardP35396 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PpardP35396 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PpardP35396 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PpardP35396 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PpardP35396 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PpardP35396 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PpardP35396 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PpardP35396 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PpardP35396 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PpardP35396 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PpardP35396 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PpardP35396 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PpardP35396 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PpardP35396 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpardP35396 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpardP35396 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpardP35396 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PpardP35396 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpardP35396 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpardP35396 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpardP35396 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpardP35396 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpardP35396 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpardP35396 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpardP35396 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpardP35396 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpardP35396 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PpardP35396 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PpardP35396 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PpardP35396 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PpardP35396 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PpardP35396 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PpardP35396 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PpardP35396 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PpardP35396 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PpardP35396 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PpardP35396 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PpardP35396 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PpardP35396 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PpardP35396 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PpardP35396 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PpardP35396 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PpardP35396 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PpardP35396 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PpardP35396 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PpardP35396 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PpardP35396 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PpardP35396 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PpardP35396 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PpardP35396 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PpardP35396 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PpardP35396 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PpardP35396 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PpardP35396 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PpardP35396 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PpardP35396 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PpardP35396 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PpardP35396 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PpardP35396 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PpardP35396 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PpardP35396 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PpardP35396 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PpardP35396 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PpardP35396 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PpardP35396 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PpardP35396 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PpardP35396 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PpardP35396 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PpardP35396 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PpardP35396 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PpardP35396 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PpardP35396 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PpardP35396 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PpardP35396 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PpardP35396 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PpardP35396 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PpardP35396 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PpardP35396 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PpardP35396 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms