Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab6aP35279 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab6aP35279 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms