Protein–RNA interactions for Protein: P33174

Kif4, Chromosome-associated kinesin KIF4, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif4P33174 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif4P33174 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif4P33174 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif4P33174 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif4P33174 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif4P33174 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif4P33174 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif4P33174 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif4P33174 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kif4P33174 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kif4P33174 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms