Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Msr1P30204 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msr1P30204 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msr1P30204 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msr1P30204 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msr1P30204 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msr1P30204 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msr1P30204 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msr1P30204 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msr1P30204 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Msr1P30204 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msr1P30204 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msr1P30204 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msr1P30204 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msr1P30204 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms