Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa2P28309 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa2P28309 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa2P28309 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa2P28309 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa2P28309 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa2P28309 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa2P28309 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa2P28309 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa2P28309 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa2P28309 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa2P28309 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa2P28309 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa2P28309 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa2P28309 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa2P28309 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa2P28309 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa2P28309 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa2P28309 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa2P28309 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa2P28309 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa2P28309 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa2P28309 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa2P28309 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa2P28309 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa2P28309 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defa2P28309 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms