Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cdk11bP24788 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cdk11bP24788 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cdk11bP24788 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms