Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxb9P20615 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb9P20615 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms