Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18528 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18528 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18528 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18528 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18528 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18528 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18528 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18528 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18528 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18528 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18528 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18528 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18528 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18528 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P18528 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P18528 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P18528 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P18528 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P18528 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P18528 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
P18528 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18528 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18528 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
P18528 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18528 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18528 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18528 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18528 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P18528 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P18528 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P18528 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P18528 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P18528 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P18528 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P18528 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18528 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18528 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18528 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18528 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18528 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P18528 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18528 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18528 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18528 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P18528 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P18528 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P18528 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P18528 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P18528 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P18528 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P18528 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P18528 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18528 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18528 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18528 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18528 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18528 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18528 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18528 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18528 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18528 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18528 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
P18528 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
P18528 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P18528 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18528 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18528 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18528 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18528 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18528 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18528 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18528 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18528 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18528 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18528 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18528 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18528 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18528 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18528 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18528 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P18528 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18528 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18528 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18528 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18528 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18528 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18528 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18528 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18528 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18528 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18528 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18528 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18528 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18528 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18528 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18528 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18528 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18528 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
P18528 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms