Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim30aP15533 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30aP15533 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30aP15533 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms