Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msh3P13705 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Msh3P13705 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msh3P13705 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msh3P13705 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msh3P13705 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msh3P13705 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msh3P13705 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msh3P13705 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms