Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prf1P10820 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prf1P10820 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prf1P10820 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prf1P10820 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prf1P10820 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prf1P10820 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prf1P10820 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prf1P10820 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prf1P10820 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prf1P10820 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prf1P10820 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms