Protein–RNA interactions for Protein: P05367

Saa2, Serum amyloid A-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa2P05367 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Saa2P05367 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Saa2P05367 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Saa2P05367 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Saa2P05367 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Saa2P05367 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Saa2P05367 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Saa2P05367 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Saa2P05367 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms